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Excel用(yòng)作(zuò)細胞內(nèi)鈣瞬态的(de)¥​™多(duō)元回歸分(fēn)析

發布時(shí)間(jiān):2018♠β-09-10 浏覽次數(shù):1053次

在科(kē)研工(gōng)作(zuò)中,要(yào)将原始實£∞£₹驗數(shù)據轉化(huà)為(wèi)可(k>‌∑ě)理(lǐ)解的(de)信息(如(rú)生(shēng)理(lǐ)學信≈ ×息、物(wù)理(lǐ)學信息、化(huà)學信息等<'±等),或者将實驗參數(shù)與結果的(de)關系歸納為(wèiβ')理(lǐ)論模型(如(rú)經驗公式),往‌ ≠往需要(yào)進行(xíng)一(yī)系列的(de)繁雜(z ×±πá)處理(lǐ)流程(如(rú)原始數(sh♦≥&∏ù)據轉換、數(shù)據計(jì)算(suàn)、回歸分('≥εfēn)析等等)。

市(shì)面上(shàng)的(de)商業(yè)軟件(jiàn),如(rúΩ≠α)ClampFit(Molecular dev♣↓↑÷ices LLC)和(hé)SigmaPlot (♠₽Systat software Inc.),一(yī)般隻能(↔∏>"néng)夠執行(xíng)整個(gè)流程中的(de¥÷)一(yī)部分(fēn),無法有(yǒu)效的(de)完Ω™成所有(yǒu)步驟。

研究人(rén)員(yuán)往往不(bù)得(de)不(bù)€γ¥先将原始數(shù)據記錄在Excel電(diàn)子(zǐ)表格§ >中,用(yòng)電(diàn)子(zǐ)表格公式進行(xí¶≈≥ng)數(shù)據轉換和(hé)基本的(de)計(jì)算(suà"¶♣n),再用(yòng)專業(yè)軟件(jiàn)進行(xíng)回歸♣γ∑分(fēn)析。這(zhè)樣的(de)工(gōng)作(zu≤<ò)模式步驟不(bù)連貫,效率較低(dī)

以細胞內(nèi)鈣瞬态分(fēn)析為(wèi)例,可(kě)以深切感&☆♠‍受到(dào)整個(gè)處理(lǐ)流程的(de)複雜(zá)♣∞÷∞,以及将整個(gè)流程分(fēn)割到(dào)不(bù) πσ同的(de)軟件(jiàn)中進行(xíng)的(de)弊端。如(r&↕¶♣ú)下(xià)圖:

也(yě)許不(bù)少(shǎo)的(de)讀(dú)者都(•ε₽dōu)設想過将整個(gè)處理(lǐ)過&♠程集中到(dào)Excel中完成,但(dàn)最終大(d ≈←à)多(duō)因為(wèi)覺得(de)Excel的(de)數(sh÷₽ù)據拟合功能(néng)比不(bù)上♣₩(shàng)專業(yè)軟件(jiàn)而作(€×α‌zuò)罷。

實際上(shàng),Excel可(kě)↕♣λ以實現(xiàn)的(de)數(shù)據拟合功能(®σ¥néng)一(yī)點不(bù)比專業(yè)軟件(jiàn)差,下(xi×←>à)邊将介紹一(yī)個(gè)Excel用(yòng)作(zuò)細胞內(‌ ♠δnèi)鈣瞬态分(fēn)析的(de)一(yī)站(zhàn§γ)式數(shù)據處理(lǐ)的(de)例子(zǐ₹ )。

其處理(lǐ)流程如(rú)下(xià):

1.數(shù)據輸入與處理(lǐ)

如(rú)上(shàng)圖:①先在A區(qū)域輸入(導入)原始數(sΩ®♣‍hù)據(電(diàn)壓檢測值);②在B、C區(qū)域選擇處理(×®lǐ)方法;③在圖D中通(tōng)過遊标E和(hé)滾動條F定¶λ義初始參數(shù);④點擊G區(qū)Calibrate•>€§進行(xíng)數(shù)據處理(lǐ)。

2.計(jì)算(suàn)細胞內(nèi)鈣瞬态的(∞'≥de)絕對(duì)值

如(rú)上(shàng)圖:①選擇參數(shù);②點擊D♣☆raw按鈕計(jì)算(suàn)鈣瞬态絕對(duì)×→↔值曲線;③可(kě)以方便地(dì)在圖中進行(xíng)拖動和(hé♦β∏♥)縮放(fàng);④可(kě)以方便查看(kàn)舒張值★ ♦、峰值及收縮值等。

3.數(shù)據拟合

同時(shí)進行(xíng)兩種模式的(de)拟合:§®參數(shù)對(duì)比展示,便于确定最優拟合方式

同時(shí)進行(xíng)兩種模式的(de)拟合:可(kě)視(shì)€$<化(huà)對(duì)比,便于确定最有(yǒu)拟合方 '式。

可(kě)進行(xíng)複雜(zá)模式的(↕αde)曲線拟合(多(duō)元回歸):途中藍(> >→lán)線為(wèi)雙指數(shù)方程拟合結果,紅(hónΩσ↑g)色為(wèi)單指數(shù)方程拟合結果。

Excel拟合結果與商業(yè)軟件(jiàn)結果完全一(γλyī)緻。

可(kě)見(jiàn),運用(yòng)Excel進行(xíng)複∑≥雜(zá)的(de)多(duō)元回歸分(fē±★n)析并不(bù)比商業(yè)軟件(jiàn)的(de)效果£✘&×差。

但(dàn)與商用(yòng)軟件(jiàn)相(xiàngε♠)比,其具有(yǒu)更多(duō)的(de)顯著優®≠ ₩勢:

1) 任何一(yī)台能(néng)夠運行(xíng)Mic§✘δ÷rosoft Excel的(de)PC機(jī)都±♦®¶(dōu)能(néng)運行(xíng)→€÷。

2) 數(shù)據輸入、數(shù)據處理(φ£♦lǐ)、結果顯示,均在同一(yī)個(gè)Excel≈π工(gōng)作(zuò)簿中進行(xíng),易于熟悉和↔λ€§(hé)使用(yòng)。

3) 采用(yòng)邏輯工(gōng)作(zuò)流,将實際步驟在exδ↕★★cel中進行(xíng)排序,确定原始數(shù)據輸入、處理<↓(lǐ)有(yǒu)序。

4) 原始數(shù)據、數(shù)據處理±β↑↑(lǐ)結果、計(jì)算(suàn)結果和(hé)回歸分(εεfēn)析結果都(dōu)存儲在一(yī)個(λ↓​↓gè)表格,一(yī)個(gè)實驗可(kě)以存儲為(wèi)一(yīδ ε<)個(gè)獨立的(de)表格。後續重新分(fēn)析可(Ω∏λ>kě)以通(tōng)過簡單地(dì)重新打開(k∞¥āi)工(gōng)作(zuò)簿來(lái)執行(®γ₹δxíng),不(bù)需要(yào)重新導入原 ‌始數(shù)據并重新導出準備/分(fēn)析的(de↓'♣<)結果。

5) 無需購(gòu)買專用(yòng)商業(yè€​±→)軟件(jiàn)。

參考文(wén)獻Computer methods and programs in biomφ≠edicine 113 (2014) 241–250:Ca analy π¥φsis: An Excel based program fo​'λr the analysis of intracellular Ca≠↑α>lcium transients including multipleε₩<, simultaneous regression©★ analysis。