無紙(zhǐ)化(huà)微(wēi)生($↔×shēng)物(wù)實驗室的(de)實現(xiàn)

位于英國(guó)Colindale的(de)中心公共衛生≠₹€₹(shēng)實驗室（CPHL）是(shì)英國(guó)醫(yī)學微(£ >₹wēi)生(shēng)物(wù)學國(guó)家(jiā)級的¥Ω(de)基準實驗室，而且是(shì)健康保護局（H ♣ PA）下(xià)屬的(de)專家(jiā)及基準微(wēi)生(sh¶•§ēng)物(wù)部（SRMD）的(deπ₽)一(yī)部分(fēn)。CPHL承擔著(zhe)為(✘≠wèi)區(qū)域實驗室，NHS醫(yī)院實驗室，傳染病防治顧問(w∏♠èn)，社區(qū)和(hé)醫(yī)院的≥ ≤Ω(de)醫(yī)生(shēng)，環境衛生(shē"™≤£ng)人(rén)員(yuán)，政府和(hé)行(xíng)業(yè)顧≠♠≠問(wèn)提供專業(yè)知(zhī)識和(hé)建議(yì)的€ (de)職責。

最近(jìn)為(wèi)期兩年(nián)的(de)<♠λ♣實驗室信息管理(lǐ)系統（LIMS）實施工(gōng)作≈‌(zuò)在CPHL進入到(dào)最後階段。該項≠₩±目的(de)主要(yào)目标是(shì)提供一(yī)個(gè)成套的(de←φ)即用(yòng)型系統，結合部分(fēn)定制✘↔(zhì)開(kāi)發，以滿足CPHL實驗室的(de)π←♠需求。

CPHL由五個(gè)部門(mén)、9個( β☆×gè)實驗室組成。此前已經為(wèi)四個(gè)實驗室單獨開(kāi)∑'發Oracle系統管理(lǐ)實驗室的(de)數(s♠→ hù)據。其他(tā)的(de)實驗室有(™'≤yǒu)的(de)運行(xíng)自(zì)有(yǒu)的(α≠♥de)獨立系統，或者完全沒有(yǒu)使用(<∏£yòng)任何信息化(huà)系統。因此，迫切需要(yào)一(yī)個(gè≥®₹)集成的(de)實驗室信息系統以高(gāo)效地(dì)采集↑∑和(hé)處理(lǐ)病人(rén)和(hé)樣本的(de)數(shù)據。系γ↕≤統還(hái)同時(shí)要(yào)考慮疾病暴發時(s§​±£hí)的(de)情況，以及與包括傳染病監測≤±≈↕中心（CDSC）在內(nèi)HPA其他δπ♥π(tā)分(fēn)部共享數(shù)據的(de)需要(yào)®♦。系統需要(yào)提供傳染病在當地(dì)，區(qū)域，國(guó)家( ↕"✔jiā)和(hé)國(guó)際的(de)流行(xíng)報☆λ(bào)告，統計(jì)數(shù)據和(hé)其他(tā)相(x♦ iàng)關數(shù)據。管理(lǐ)信息還(hái)須提供關鍵績效指标。

英國(guó)的(de)Sysmex公司承接下( ‌‌xià)了(le)該合同。由于CPHL的(de)工(gōng)作(zuò→↕)性質具有(yǒu)季節性變化(huà)的(de)特點，因此✔ε決定在2年(nián)多(duō)的(de)時(shí)間(jiān)裡(lǐ®≠₽≤)分(fēn)步實施，而不(bù)是(shì)選擇一(yī)蹴而就(jiù<δ)的(de)方法。

 實施

實施過程劃分(fēn)為(wèi)五個(gè)階段開(kα♣Ωāi)展，在試點單位正式上(shàng)線之前，大(dà)部分(fēnφε )定制(zhì)化(huà)的(de)功能(néng)都σ¶π (dōu)已經完成。試點實驗室為(wèi)免疫接種和(hé)診λ♦斷部，屬于腸道(dào)、呼吸道(dào)和(hé)神經病毒實驗室（E™↔RNVL），于2003年(nián)1月(yuè)≠¥↓•開(kāi)始試運行(xíng)。該單位每天處理(lǐ)100-150個©§₽∏(gè)樣本。其他(tā)實驗室的(de)上(shàng)線日(rì)期與每↓≠€♠個(gè)實驗室主任商定，并考慮當年(nián)α∑←所在的(de)時(shí)間(jiān)節點，資源的(®÷de)可(kě)用(yòng)性和(hé)實驗室的(de)方便 £‍性。這(zhè)樣可(kě)以避免在實驗室工(gōng↕')作(zuò)的(de)繁忙時(shí)期實施系統•←從(cóng)而給員(yuán)工(gōng)帶來(lσ↔γái)過多(duō)的(de)壓力。

項目全程由一(yī)個(gè)穩定的(de)項目小≤$↓σ(xiǎo)組進行(xíng)LIMS的(de)實施。每個(gè)實驗室都(♣↕¶dōu)至少(shǎo)派出一(yī)名代表≥α擔任項目成員(yuán)。這(zhè)些(xiē)✘ε§工(gōng)作(zuò)人(rén)員(yuá>∏•™n)成為(wèi)該信息化(huà)項目組與最終用(yòng)戶之間(  δjiān)的(de)溝通(tōng)橋梁，同時(shí)他(tā)們對(duσσ↓ì)實驗室的(de)政策制(zhì)度以及∞≥規程提出修改意見(jiàn)以最優化(huà)系統運行'&☆•(xíng)。項目團隊的(de)成員(yuán)接受了(le)LIMS“超級✘®©用(yòng)戶”的(de)相(xiàng)關技(jì)術(shù)培訓，使←<±ε他(tā)們能(néng)夠承擔部分(fēn)的(de)實施工(gōng)作≤'(zuò)和(hé)應對(duì)未來(lái)可(δ☆ kě)能(néng)發生(shēng)的(de)變化(huàβ> )，協助解答(dá)疑問(wèn)，并提供內( λnèi)部培訓。因此，CPHL可(kě)以培養出具有(>↓& yǒu)專業(yè)知(zhī)識的(de)©™σ>內(nèi)部人(rén)員(yuán)₹✘™'來(lái)管理(lǐ)系統，而不(bù"×€)是(shì)僅僅依賴于供應商。如(rú)↓₽☆φ今這(zhè)個(gè)目的(de)已經非常圓滿地(dì)達到(dào)。現←↓π→(xiàn)在每一(yī)個(gè)實驗室都(dōu)有(yǒu‍®‍♣)一(yī)名實驗室信息管理(lǐ)系統的(de)“超級用(y→©òng)戶”，這(zhè)些(xiē)超級用(↔€¶yòng)戶十分(fēn)熟悉他(tā)們‌δ的(de)實驗室的(de)參數(shù)設置。

采用(yòng)團隊化(huà)的(de)方法是(shì)項目成功的(de)♣♥£主要(yào)因素。還(hái)有(yǒu)的(de)就(jiù)是(s✘•hì)與最終用(yòng)戶的(de)有(yǒu₹ )效溝通(tōng)，多(duō)領域意見(j¶Ω♥δiàn)征集的(de)決策過程。用(yòng)戶接受度的(d¶α♥e)被公認為(wèi)最大(dà)的(de)潛在障礙之一(yγ←ī)。對(duì)于那(nà)些(xiē)已經使用(yòng)原有λ$✘©(yǒu)的(de)Oracle 系統10多(duō)年(niánε$)的(de)用(yòng)戶來(lái)說(shuō)，使用(yòngεα®)習(xí)慣的(de)轉變尤為(wèi)具有(yǒu)λ‍≈←挑戰性。為(wèi)了(le)促進習(xí)慣的(de)改變，實施過程中采用(§≥yòng)定期的(de)團隊會(huì)議(yìεγ)，高(gāo)頻(pín)次的(de)功能(néng)郵件(jiàn)通(t "←ōng)報(bào)，Demo演示和(hé)討(±★tǎo)論會(huì)議(yì)，使得(de)工(gōng≈≥)作(zuò)人(rén)員(yuán)逐步适應新的( ‍δde)變化(huà)。

CPHL很(hěn)快(kuài)就(ji®βù)意識到(dào)有(yǒu)必要(yào)給項目組提供額外(wài)的♦↕(de)資源以支持實施工(gōng)作(zuò)，包括用(yònε↓σg)戶培訓、管理(lǐ)制(zhì)度和(hé)IT的(de)輔助支持。試點πΩ∑單位上(shàng)線以後，培訓講師(shī)就(jiù≈λ)開(kāi)始培訓所有(yǒu)其他(tā)最終用(yòng)戶，并建立了(‌¶&"le)一(yī)個(gè)資訊台充當LIMS支持團隊和(hé)用★​≠≠(yòng)戶之間(jiān)溝通(tōng)的(de)橋梁。

現(xiàn)在CPHL的(de)實驗室已經有(yǒu)γ‌σ←一(yī)個(gè)統一(yī)的(de)LIMS系統（Syλ§φ‌smex MOLIS），并且加入了(le)若幹定制(zhì)開∏↕(kāi)發的(de)應用(yòng)。它已在CPHL的(de)八∏‍‍€個(gè)實驗室得(de)到(dào)應用(γ ☆yòng)，包括最後加入的(de)性傳播感γ≈•¥染與細菌實驗室（STBRL）。該項目實現(xi☆™àn)的(de)主要(yào)好(hǎo)處是(s∑♥"hì)：改善了(le)應對(duì)工(gōn÷Ω±♦g)作(zuò)請(qǐng)求的(de ₩★ )周轉時(shí)間(jiān); 更好(hǎβ$o)地(dì)記錄疾病爆發數(shù)據; 優秀的(↔×λde)樣本跟蹤; 提高(gāo)↔♣₹了(le)準确度; 和(hé)∑₽‍實時(shí)的(de)統計(jì)整個 §(gè)CPHL的(de)數(shù)據。

 無紙(zhǐ)化(huà)的(de)微(wēi)生(shēng)物π☆>♠(wù)實驗室

該項目已經給實驗室帶來(lái)了(le)™δ業(yè)務流程上(shàng)的(de)改變。實驗室接收的(de)大(dàσ↕)量樣品已經合理(lǐ)轉移到(dào)≤‍§•到(dào)中心樣本接收機(jī)構，每天大(dà)約800個(gè)樣>♣£±本（包括參考和(hé)監控）的(de)接收采用(yòng)無紙(zhǐ)✘☆化(huà)的(de)工(gōng)作(zuò)₩¥αε方式接收。

由于申請(qǐng)表在樣本注冊時(shí)就(jiù)∑≥₩φ已經掃描入庫，因此可(kě)在流程中的(de)每一(yī)個(g×γè)節點上(shàng)在屏幕上(shàng)查看(kàn)具體(t®εǐ)的(de)申請(qǐng)信息。 系統一(yī)個(gè)主要§§(yào)的(de)優點是(shì)，它允許根據各個(gè)實驗室的(de)具♥↕≈↑體(tǐ)需求采集更多(duō)的(de)數(shù)據，如(rú)免疫接種日 ≥♣(rì)期和(hé)MMR監督工(gōng)作(zuò)的(de)更多(♥ ¶duō)細節，旅行(xíng)史，為(wèi∑↑₽)腸胃炎測試的(de)抗菌治療。

該系統可(kě)以幫助實驗室工(gōng)作(zuò)人★↕®Ω(rén)員(yuán)執行(xíng)日(rì)常任務，并幫助對(d‌♣uì)微(wēi)生(shēng)物(wù)測試γ&的(de)不(bù)同步驟做(zuò)出決定。每個(gè)單獨的(de¥☆∑&)工(gōng)作(zuò)步驟，測試結果和(hé)用(yòng§↑)戶信息詳細地(dì)記錄在電(diàn)子(zǐ>♠↓≠)表格中。這(zhè)些(xiē)結構化(huà)的(dγ✘¥e)和(hé)可(kě)搜索的(de)工(gπ≤®∏ōng)作(zuò)表可(kě)以采用(y♦∑òng)樹(shù)形結構折疊和(hé)展開(kā ₩i)。在實施過程中，該小(xiǎo)組已确定約230個(↑"gè)不(bù)同類型的(de)樣本以及1100種測試$α​選項。一(yī)個(gè)綜合性醫(yī)院類型微(wēσΩ≠i)生(shēng)物(wù)學部門(mén)使用(yòng)MOLISβ÷φ大(dà)約有(yǒu)200步。CPHL在微(wēi)生(shē☆∞₽ng)物(wù)學工(gōng)作(zuò)區(qū)管理∑Ω¶(lǐ)器(qì)（Microbiolog≤φy Work Area Manager）中定義了(le)37₩λ50個(gè)不(bù)同的(de)步驟和(hé)1500×>₽0個(gè)不(bù)同的(de)結果代碼。精心設計(jì)¶‌β的(de)邏輯編碼簡化(huà)搜索，數(shù)據輸入過程中÷Ωπ避免歧義。通(tōng)過連接相(xiàng)對(duγ≠≥ì)“沉默”的(de)設備，這(zhè)套新系統♥✔×相(xiàng)比以前提供了(le)更大(dà)程度的(de₩Ω)自(zì)動化(huà)。在性傳播和(hé)血源性病毒實驗室（SBVL），結 ₽果的(de)自(zì)動下(xià)載特别節省時(shí)間(jiā®₩n)。除了(le)酶标儀接口，Sysmex也(yě)與CDSC監₩¶控系統Labbase2做(zuò)了(le)整合。α♥

由于CPHL監測和(hé)研究工(gōng)作(zuò)  ®‍的(de)性質，樣品跟蹤和(hé)存檔成為(wèi)建立LIMS的(dΩ∑Ω₹e)重要(yào)出發點。每個(gè)樣本，分(fēn)裝單元Ω€♥和(hé)培養基都(dōu)貼上(shàng)了(₩£le)條形碼，從(cóng)登記入庫到(dào)歸檔都(dōu)可(kě)以跟∏↕&☆蹤。歸檔功能(néng)可(kě)以對(duì)放(fàn£♥g)置在冰箱或培養庫中的(de)樣品進行(xíng)跟蹤★&和(hé)定位以進行(xíng)進一(yī)步的(de)測試。CPHL各個 γα≥(gè)層面廣泛使用(yòng)了(le)MOLIS規則•₽γ庫和(hé)決策表，例如(rú)噬菌體(tǐ)類型衍化(huà)和(hé₹")樣品路(lù)徑。無紙(zhǐ)化(huà)✔‌→×環境的(de)其他(tā)功能(néng)還(hái)包括标準化(huà)的(≈®¥de)實驗室報(bào)告生(shēng)成，以及新≠∏±®開(kāi)發的(de)疾病爆發模塊。

CPHL變化(huà)頻(pín)繁的(de)工(gōng)作£ε(zuò)性質和(hé)新測試方法的(de)不(bù)斷發展，✔☆±客觀上(shàng)要(yào)求MOLIS能(néng)夠♣ 快(kuài)速修改和(hé)增加測試和(hé)代碼而不(bù)影(yǐn&•g)響日(rì)常工(gōng)作(zu♣‍∞ò)或者損害曆史數(shù)據。這(zhè)在2003年(nián)SARα↑£S暴發時(shí)表現(xiàn)得(de)尤為'∏♦↑(wèi)引人(rén)注目，當時(shí)₹α₽需要(yào)在剛實施的(de)ERNVL模塊中快(ku₽αài)速添加一(yī)個(gè)全新的(÷∞☆de)試驗組。令人(rén)欣喜的(de)是(shì)，包↕$括測試項目，特定人(rén)群，結果代碼，工(gōng)作(z§₩<™uò)列表和(hé)樣品路(lù)徑等工☆ (gōng)作(zuò)都(dōu)是(shì)由CPHL的(d£♥e)人(rén)員(yuán)自(zì)行(x>₽íng)建立的(de)，而非供應商Sysmex的(de)工(gōngε←)作(zuò)人(rén)員(yuán)。

 未來(lái)計(jì)劃

從(cóng)試點實驗室的(de)上(shàng)線，到(d✔§βào)所有(yǒu)實驗室在1月(yuè)份全部上(shàng)線，組織和>δ(hé)員(yuán)工(gōng)之間(jiān)建立了(le)十分(fēn≠δ)良好(hǎo)互信關系。項目按時(shí)完成并且沒有(↕€yǒu)超出預算(suàn)，該項目被各方看(kàn)作(ε≥zuò)是(shì)一(yī)個(gè)巨大(dà)的(de)成功‌ ✔。最初的(de)合作(zuò)方式已被證明₹≥♥(míng)是(shì)取得(de)這(zhè)一(yī)成果σ≠↔的(de)關鍵因素。更高(gāo)層次的(d ¥→™e)信任也(yě)催生(shēng)出一(yī)些(xiē)額外"φ‍♣(wài)的(de)項目成果。